Проведен молекулярно-генетический анализ кормовых бобовых культур (клевера лугового, люпина разных видов, лядвенца рогатого и Крылова) с применением 31 комбинации SRAP-маркеров. Для каждой культуры подобраны наборы информативных праймеров для оценки генетического разнообразия. Определены показатели, отражающие межвидовой и межсортовой полиморфизм ДНК: эффективное количество аллелей, индекс генетического разнообразия по Нею, индекс Шеннона. На основании данных генотипирования построены дендрограммы генетического сходства с помощью методов UPGMA и анализа главных координат (PCoA), которые, большей частью, сгруппировали изучаемые образцы в соответствии с их происхождением. Значения PIC (показателя информативности праймеров) оказались высокими для всех изучаемых видов, с вариациями от 0,76 у клевера лугового, до 0,81 в коллекции люпина. Полученные результаты свидетельствуют об эффективности метода SRAP-маркирования для изучения генетической структуры популяций разных видов бобовых трав и для оценки межсортовой генетической изменчивости; могут использоваться для улучшения селекционных программ по кормовым культурам.
кормовые бобовые культуры, молекулярно-генетический анализ, SRAP-маркеры, генетический полиморфизм, кластерный анализ
1. Соловьева Ю.А., Соловьев А.В. Бобовые — основной источник обеспеченности животных растительным кормом // Состояние среды обитания и фауна охотничьих животных России и сопредельных территорий: Материалы III Международной, VIII Всероссийской Научно-практической конференции, Москва, 18–19 марта 2024 г. – М., 2024. – С. 122–127.
2. Li G., Quiros C.F. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica. Theoretical and Applied Genetics. 2001. Vol. 103. P. 455–461.
3. Poczai P., Varga I., Laos M., Cseh A., Bell N., Valkonen J. P., & Hyvönen J. Advances in plant gene-targeted and functional markers: a review. Plant Methods. 2013. Vol. 9. P. 1–32.
4. Hale A.L., Farnham M.W., Nzaramba M.N., & Kimbeng C.A. Heterosis for horticultural traits in broccoli. Theoretical and Applied Genetics. 2007. Vol. 115. P. 351–360.
5. Liu L.W., Gong Y.Q., Huang H., & Zhu X.W. Novel molecular marker systems-SRAP and TRAP and their application. Yi Chuan = Hereditas. 2004. Vol. 26, No. 5. P. 777–781.
6. Wei B., Cao L., Li S., Huang D., Cai G., & Lu X. Population structure of Euodia rutaecarpa in China revealed by amplified fragment length polymorphism (AFLP) and sequence-related amplified polymorphism (SRAP). Journal of Medicinal Plants Research. 2011. Vol. 5, No. 30. P. 6628–6635.
7. Эффективный способ выделения ДНК для ПЦР-анализа из «балк-образцов» проростков / И.А. Клименко, А.А. Антонов, В.А. Душкин, А.О. Шамустакимова, Ю.М. Мавлютов // Адаптивное кормопроизводство. – 2021. – № 3. – С. 29–48.
8. Yeh F.C. POPGENE (version 1.3. 1): Microsoft window-based freeware for population genetic analysis [Electronic resource]. Available at: http://www.ualberta.ca/~fyeh/. – 1999.
9. Aneja B., Yadav N.R., Chawla V., & Yadav R.C. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP) molecular marker system and its applications in crop improvement. Molecular Breeding. 2012. Vol. 30. P. 1635–1648.
10. Шамустакимова А.О., Мавлютов Ю.М., Клименко И.А. Применение SRAP-маркеров для ДНК-идентификации российских сортов люцерны // Генетика. – 2021. – Т. 57, № 5. – С. 536–543.
11. Talebi M., Hajiahmadi Z., Rahimmalek M. Genetic diversity and population structure of four Iranian alfalfa populations revealed by sequence-related amplified polymorphism (SRAP) markers. Journal of Crop Science and Biotechnology. 2011. Vol. 14. P. 173–178.
12. Castonguay Y., Cloutier J., Bertrand A., Michaud R., & Laberge S. SRAP polymorphisms associated with superior freezing tolerance in alfalfa (Medicago sativa spp. sativa). Theoretical and Applied Genetics. 2010. Vol. 120. P. 1611–1619.
