Adaptive Fodder Production Adaptive Fodder Production Адаптивное кормопроизводство 2222-5366 94867 10.33814/AFP-2222-5366-2024-4-18-26 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЕ РАБОТЫ EXPERIMENTAL RESEARCH WORK ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЕ РАБОТЫ Application of scot markers for evaluation of the genetic variability of blue-grass varieties (Poa pratensis L.) Применение scot-маркеров для оценки генетической изменчивости сортов мятлика лугового (Poa pratensis L.) Кривопуск Екатерина Юрьевна Krivopusk Ekaterina Yur'evna Мавлютов Юлиан Муратович Mavlyutov Yulian Muratovich ФНЦ «ВИК им. В.Р. Вильямса» Россия ФНЦ «ВИК им. В.Р. Вильямса» Russian Federation Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный научный центр кормопроизводства и агроэкологии имени В.Р. Вильямса» Лобня Россия Federal State Budget Sciences Institution «Federal Williams Research Center of Forage Production and Agroecology» Lobnya Russian Federation 12 02 2025 12 02 2025 2024 4 18 26 10 02 2025 https://adaptagro.editorum.ru/en/nauka/article/94867/view

Проведен анализ по оценке межсортового генетического полиморфизма мятлика лугового (Poa pratensis L.) на основе ПЦР-технологии с использованием девяти SCoT-маркеров. Определены информативные праймеры для дифференциации сортов, рассчитаны показатели оценки генетического разнообразия: индексы Шеннона и Нея, эффективное число аллелей, показатель информационного содержания праймеров (PIC — polymorphism information content). С помощью дендрограммы филогенетических отношений, построенной методом Neighbor-Joining, и анализа главных координат (PCoA — principal coordinates analysis) проведена оценка генетической структуры изучаемой коллекции. В результате исследований составлены молекулярные формулы, которые могут быть использованы в качестве индивидуальной характеристики оригинальности сорта и для его ДНК-паспортизации.

The analysis was conducted to assess the inter-varietal genetic polymorphism of Poa pratensis based on PCR technology using nine SCoT markers. The informative primers for variety differentiation have been identified; parameters of genetic diversity were estimated: Shannon’s index, Nei’s genetic diversity index, effective number of alleles and the indicator of the information content of primers (PIC — polymorphism information content). Genetic structure of the analyzed collection was evaluated using the Neighbor-Joining dendrogram and PCoA-analysis. As a result of the research, molecular formulas were developed that can be used as the individual characteristic of the variety originality and for DNA certification.

 мятлик луговой генетическое разнообразие кластерный анализ межсортовой ДНК-полиморфизм SCoT-маркеры дендрограмма генетического сходства blue-grass (Poa pratensis L.) genetic diversity cluster analysis inter-varietal DNA polymorphism SCoT markers dendrogram of the genetic relationship

Глазунов В.А. Мятликовые // Большая российская энциклопедия: научно-образовательный портал [Электронный ресурс]. URL: https://bigenc.ru/c/zlaki-809ee4/?v=9176688 (дата публикации: 04.12.2023). Glazunov V.A. Myatlikovye // Bol'shaya rossiyskaya enciklopediya: nauchno-obrazovatel'nyy portal [Elektronnyy resurs]. URL: https://bigenc.ru/c/zlaki-809ee4/?v=9176688 (data publikacii: 04.12.2023). Князева Т.В., Ульянов В.С. Луговое кормопроизводство : методические рекомендации. – Краснодар : КубГАУ, 2017. – 78 с. Knyazeva T.V., Ul'yanov V.S. Lugovoe kormoproizvodstvo : metodicheskie rekomendacii. – Krasnodar : KubGAU, 2017. – 78 s. Лукиных Г.Л., Луганская С.Н. Морфобиологическая характеристика многолетних злаковых трав, используемых для создания газонов в условиях Среднего Урала : метод. пособие для студентов очной и заочной форм обучения. – Екатеринбург : УГЛТУ, 2010. – 36 с. Lukinyh G.L., Luganskaya S.N. Morfobiologicheskaya harakteristika mnogoletnih zlakovyh trav, ispol'zuemyh dlya sozdaniya gazonov v usloviyah Srednego Urala : metod. posobie dlya studentov ochnoy i zaochnoy form obucheniya. – Ekaterinburg : UGLTU, 2010. – 36 s. Принципы организации территории кормовых угодий : учеб.-метод. пособие / А.С. Голубь [и др.]. – Ставрополь : СтГАУ, 2020 с. – 103. Principy organizacii territorii kormovyh ugodiy : ucheb.-metod. posobie / A.S. Golub' [i dr.]. – Stavropol' : StGAU, 2020 s. – 103. Кутузова А.А. Лекции послевузовского образования по специальности 06.01.06 – луговодство, лекарственные и эфирно-масличные культуры. – М. : Угрешская типография, 2013. – 115 с. Kutuzova A.A. Lekcii poslevuzovskogo obrazovaniya po special'nosti 06.01.06 – lugovodstvo, lekarstvennye i efirno-maslichnye kul'tury. – M. : Ugreshskaya tipografiya, 2013. – 115 s. Mavlyutov Yu.M., Kostenko, S.I., Shamustakimova A.O., Klimenko I.A. Genetic variability analysis of Russian cultivars of ryegrass (Lolium) based on SCoT markers. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology, 2022, vol. 20, no. 1, p. 163. Mavlyutov Yu.M., Kostenko, S.I., Shamustakimova A.O., Klimenko I.A. Genetic variability analysis of Russian cultivars of ryegrass (Lolium) based on SCoT markers. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology, 2022, vol. 20, no. 1, p. 163. Мавлютов Ю.М., Вертикова Е.А., Шамустакимова А.О., Клименко И.А. Изучение генетической структуры коллекции сортов райграса (Lolium) с использованием SSR- и SCoT-марке-ров // Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. – 2023. – Т. 184, №3. – С. 146–160. Mavlyutov Yu.M., Vertikova E.A., Shamustakimova A.O., Klimenko I.A. Izuchenie geneticheskoy struktury kollekcii sortov raygrasa (Lolium) s ispol'zovaniem SSR- i SCoT-marke-rov // Trudy po prikladnoy botanike, genetike i selekcii. – 2023. – T. 184, №3. – S. 146–160. Tabaripour R., Keshavarzi M. Interspecific Molecular Variation of Lolium L. Based on ISSR, SCoT and ITS. Iranian Journal of Science and Technology, Transactions A: Science, 2021, vol. 45, pp. 1263–1272. Tabaripour R., Keshavarzi M. Interspecific Molecular Variation of Lolium L. Based on ISSR, SCoT and ITS. Iranian Journal of Science and Technology, Transactions A: Science, 2021, vol. 45, pp. 1263–1272. ГОСТ 12038-84. Семена сельскохозяйственных культур. Методы определения всхожести. – М. : Стандартинформ, 2011. – 31 с. GOST 12038-84. Semena sel'skohozyaystvennyh kul'tur. Metody opredeleniya vshozhesti. – M. : Standartinform, 2011. – 31 s. Эффективный способ выделения ДНК для ПЦР-анализа из «балк-образцов» проростков / И.А. Клименко, А.А. Антонов, В.А. Душкин, А.О. Шамустакимова, Ю.М. Мавлютов // Адаптивное кормопроизводство. – 2021. – № 3. – С. 29–48. URL: http://www.adaptagro.ru. Effektivnyy sposob vydeleniya DNK dlya PCR-analiza iz «balk-obrazcov» prorostkov / I.A. Klimenko, A.A. Antonov, V.A. Dushkin, A.O. Shamustakimova, Yu.M. Mavlyutov // Adaptivnoe kormoproizvodstvo. – 2021. – № 3. – S. 29–48. URL: http://www.adaptagro.ru. Collard B.C.Y., Mackill D.J. Start Codon Targeted (SCoT) Polymorphism: A Simple, Novel DNA Marker Technique for Generating Gene-Targeted Markers in Plants. Plant Molecular Biology Reporter, 2009, vol. 27, pp. 86–93. Collard B.C.Y., Mackill D.J. Start Codon Targeted (SCoT) Polymorphism: A Simple, Novel DNA Marker Technique for Generating Gene-Targeted Markers in Plants. Plant Molecular Biology Reporter, 2009, vol. 27, pp. 86–93. Yeh F.C. POPGENE (version 1.3.1): Microsoft window-based freeware for population genetic analysis [Electronic resource]. Available at: http://www.ualberta.ca/~fyeh/. – 1999. Yeh F.C. POPGENE (version 1.3.1): Microsoft window-based freeware for population genetic analysis [Electronic resource]. Available at: http://www.ualberta.ca/~fyeh/. – 1999. DARwin (version 6): Dissimilarity Analysis Representation for windows [Electronic resource]. Available at https://darwin.cirad.fr/. – 2014. DARwin (version 6): Dissimilarity Analysis Representation for windows [Electronic resource]. Available at https://darwin.cirad.fr/. – 2014. Rai M.K. Start codon targeted (SCoT) polymorphism marker in plant genome analysis: current status and prospects. Planta, 2023, vol. 257, no. 2, p. 34. Rai M.K. Start codon targeted (SCoT) polymorphism marker in plant genome analysis: current status and prospects. Planta, 2023, vol. 257, no. 2, p. 34.